Praktikum Experimentelle Mikrobiologie I

Objective

Einführung in praktische Methoden der mikrobiologischen Forschung Teil Limnologie (Mikrobiologie aquatischer Ökosysteme) Einführung in die Methoden biochemischer Limnologie. Überblick über die wichtigsten Ökotypen heterotropher und phototropher aquatischer Mikroorganismen. Teil Phytopathologie Teil Pflanzen/Mikroorganismen Die Experimentelle Analyse ausgewählter Pflanzen-Pathogen-Interaktionen sowie das praktische Erlernen von dazu benötigten biochemischen und molekularbiologischen Methoden. Teil Mikrobiologie und Mykologie Die Blöcke Mikrobiologie und Mykologie sollen den Studenten/Studentinnen Einblick in die Forschungstätigkeit geben.

Content

Im Praktikum Exp. Mikrobiologie I werden vier verschiedene Blockkurse (Dauer je drei Wochen) zu den Fachgebieten Limnologie, Mykologie, Phytopathologie und molekulare Mikrobiologie angeboten. In diesen Kursen werden die Studierenden mit den verschiedensten, fachspezifischen Methoden vertraut gemacht und lernen in kleineren Experimenten deren Anwendung. Teil Limnologie (Mikrobiologie aquatischer Ökosysteme) Versuche werden zu folgenden Themen angeboten: In situ Bestimmung physikalischer und chemischer Parameter im Zürichsee; Bioassay geleitete Isolation von Toxinen aus Cyanobakterien kombiniert mit LC-ESMS; Spurenanalyse (GC-MS) und Bioassays von VOC als Infochemikalien (Attraktantien, Repellentien), Chemoklassifikation phototropher Mikroorganismen aufgrund spezifischer Lichtabsorptionen (Epifluoreszenzmikroskopie mit Image-System, Absorptions-Reader), Protease-Inhibitoren (Verdauungsenzyme) durch natürliche Inhibitoren (Fluoreszenz-Reader); PAM-Fluorimetrie als Methode zur Bestimmung des Elektronenflusses und der Lichteffizienz; Hoch-Affinitäts-Aminosäure-Bindeproteine in pelagischen Mikroorganismen. Teil Phytopathologie Es werden Versuche durchgeführt, um die Problematik der biologischen Bekämpfung, der Physiologie der Wirt-Parasit-Beziehungen und der Populationstuktur von Pathogenen besser zu erfassen. Die Versuche basieren meist auf Forschungsarbeiten des Instituts. Es wird Gelegenheit geboten, Pathogene im Mikroskop zu beobachten. Anhand von Computersimulationen kann zudem der Verlauf einer Epidemie studiert sowie der Erfolg einer Bekämpfung evaluiert werden. Am Nachmittag des letzten Tages wird jeder Student die Gelegenheit haben, einen Teil seiner Versuche im Rahmen eines kleinen Workshops darzustellen. Beispiele von Versuchen: - Krankheitsunterdrückung und Produktion von antimikrobiellen Metaboliten durch fluoreszierende Pseudomonaden - Die Kefe: Eine Pflanze wehrt sich (Phytoalexinproduktion durch die Pflanze). - Fusarium: Ein Pilz greift an (Toxinproduktion durch den Pilz). - Molekular-Tests (ELISA, PCR, Microsatelliten) für den qualitativen und quantitativen Nachweis von Pilzen und Bakterien. - Analyse weltweiter Populationen von Getreide-Blattpathogenen mittels DNS-Sequenzierung und verschiedener anderer molekularer Methoden.

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